La Regina d'Italia Margherita di Savoia, moglie del Re Umberto I, visitò Napoli nel 1889. In tale occasione, espresse il desiderio di poter gustare una specialità locale. E il cuoco Raffaele Esposito della pizzeria Brandi preparò questa pizza. La Regina Margherita rimase affascinata da questa pizza condita con pomodori, mozzarella e basilico per rappresentare i colori della bandiera italiana: verde, bianco e rosso. Per questo la regina inviò una lettera di ringraziamento al cuoco Esposito che rispose dando alla pizza il nome della regina.